La Junta de Ciències Naturals va tenir un gran paper cohesionador de les institucions dedicades al conreu de les ciències naturals a la ciutat de Barcelona. Les publicacions promogudes per la Junta són un testimoni excel·lent de la importància que va adquirir aquest organisme i de la visió avançada a la seva època que va mostrar pel que fa a la relació entre les societats desenvolupades i el respecte als recursos naturals, fonamentalment en la dècada dels anys vint del segle passat. En aquesta secció s’inclouen publicacions de la Junta entre els anys 1910 i 1937, publicacions anteriors de l’Ajuntament de Barcelona (1888-1899) i altres publicacions coetànies del Museu de Ciències Naturals de Barcelona (1922-1928) i també posteriors: les de l’Institut Municipal de Ciències Naturals (1947-1957), organisme que va continuar les funcions de la Junta després de la Guerra Civil. Tota aquesta producció científica és molt variada quant a temes (geologia, paleontologia, mineralogia, petrologia, entomologia, botànica, malacologia, vertebrats, herpetologia…) i també hi trobareu memòries i publicacions tècniques i divulgatives.
Miscel·lània Zoològica: ISSN 0211-6529, e-ISSN 2339-7330
Treballs del Museu de Zoologia: ISSN 0211-0687, e-ISSN 2385-4340
La revista Miscel·lània Zoològica va publicar el primer volum l’any 1958. Aleshores era editada pel Museu de Zoologia de Barcelona, la qual cosa explica l’especialització i el títol de la publicació, que va aparèixer anualment fins a l’any 2000. Només una interrupció durant una etapa de canvi, entre 1982 i 1983, va alterar el ritme de disseminació de dades zoològiques, que es va reprendre l’any 1984 amb una nova publicació periòdica anomenada Treballs del Museu de Zoologia de Barcelona. Aquesta segona sèrie té un caràcter monogràfic, sense un compromís definit pel que fa al calendari de publicació. L’any 1995 es va publicar l’últim dels set volums editats.
El relleu de la revista Miscel·lània Zoològica el va prendre una nova publicació, Animal Biodiversity and Conservation, orientada des del seu inici, l’any 2001, a convertir-se en vehicle de difusió de la recerca científica de qualitat en zoologia i biologia de la conservació. En la tradició de Miscel·lània Zoològica també hi havia una gran aportació de caràcter més faunístic que finalment s’ha connectat amb la creació d’una altra publicació, l’any 2004, aquesta exclusivament electrònica, Arxius de Miscel·lània Zoològica. La renovació del paper editorial representat per Miscel·lània Zoològica es veu reflectit, doncs, en l’aparició d’aquestes dues noves sèries.
En paral·lel, la línia de publicació d’estudis en profunditat Treballs del Museu de Zoologia també es va modernitzar i l’any 2003 va passar a anomenar-se Monografies del Museu de Ciències Naturals.